目的探讨神曲消食口服液联合双歧杆菌四联活菌片治疗小儿厌食症的疗效及对肠道菌群的影响。方法选取2022年1-12月该院收治的120例厌食症患儿作为研究对象，采用随机数字表法分为对照组和复合组，每组60例。对照组采用双歧杆菌四联活菌片治疗，复合组在对照组的基础上联合神曲消食口服液治疗。比较2组总有效率、疾病改善情况、血微量元素、中医证候积分、食欲调节因子指标、肠道菌群及不良反应。结果复合组总有效率为93.33%，高于对照组的80.00%，差异有统计学意义（P＜0.05）。2组治疗后主症、次症积分及肠杆菌水平均低于治疗前，且复合组治疗后食量恢复至正常时间短于对照组，主症、次症积分及肠杆菌水平均低于对照组，差异均有统计学意义（P＜0.05）。2组治疗后神经肽Y（NPY）、双歧杆菌、乳酸杆菌、血微量元素（铁、锌、钙）、促食欲素水平均高于治疗前，且复合组治疗后体质量增加量及NPY、双歧杆菌、乳酸杆菌、血微量元素（铁、锌、钙）、促食欲素水平均高于对照组，差异均有统计学意义（P＜0.05）。2组呕吐、轻微皮疹、腹泻腹胀、头晕等不良反应总发生率比较，差异无统计学意义（P>0.05）。结论厌食症患儿接受神曲消食口服液联合双歧杆菌四联活菌片治疗，可有效增强食欲，改善肠道菌群，临床疗效较为理想。