结核性脑膜炎（TBM）是一种由结核分枝杆菌引起的中枢神经系统感染，具有高致死率和致残率，早期诊断对改善预后至关重要。传统的诊断方法存在灵敏度低、耗时长等缺点，而宏基因组二代测序（mNGS）作为一种新型分子诊断技术，为TBM的早期诊断提供了新的可能。该文总结了mNGS在TBM诊断中的应用进展，重点从mNGS的检测优势和局限性2个方面叙述。与传统检测方法比较，mNGS在不同类型TBM患者中均有较高的灵敏度；mNGS与TBM传统检测方法联合使用，可进一步提升TBM患者的检出率；mNGS具有广谱无偏倚检测的优势；同时mNGS检出率受治疗影响较小。然而，mNGS在应用中仍面临假阴性、预测耐药性能力有限、数据分析依赖专业人员、缺乏标准化流程与质控体系、成本高、周期长等局限性。尽管mNGS在TBM诊断中展现出巨大潜力，但其尚未成为一线诊断工具，主要受限于技术局限性和应用成本等因素。未来需推动mNGS的标准化流程建设，完善耐药性预测能力，加强专业人员培训，降低检测成本，以促进mNGS技术在TBM诊断中的广泛应用，使其真正成为临床常规诊断手段。