目的探讨皮肤鳞状细胞癌（CSCC）组织微小RNA（miR）-20a、miR-196a表达水平与临床病理特征和预后的关系。方法选取2014年1月至2018年1月在该院行手术切除并随访成功的CSCC患者316例作为研究对象。采用实时荧光定量聚合酶链反应检测术中留取CSCC患者癌组织和癌旁组织（距离癌组织＞3 cm）中miR-20a、miR-196a表达水平。分析miR-20a、miR-196a表达水平与CSCC临床病理特征的关系。采用多因素Logistic回归分析影响CSCC患者预后不良的因素。根据CSCC患者癌组织中miR-20a、miR-196a表达水平的均值分为miR-20a高表达组、miR-20a低表达组和miR-196a高表达组、miR-196a低表达组。绘制Kaplan-Meier曲线分析miR-20a高表达组、miR-20a低表达组和miR-196a高表达组、miR-196a低表达组患者的5年生存差异。结果与癌旁组织比较，CSCC患者癌组织中miR-20a表达水平降低，miR-196a表达水平升高，差异均有统计学意义（P＜0.05）。不同分化程度、TNM分期及是否发生淋巴结转移CSCC患者的miR-20a、miR-196a表达水平比较，差异均有统计学意义（P＜0.05）。随访5年，58例CSCC患者死亡（死亡组），258例生存（存活组），5年总生存率为81.65%(258/316)。死亡组低分化患者比例、TNM Ⅲ期患者比例、有淋巴结转移患者比例及癌组织中miR-196a表达水平高于存活组，而癌组织中miR-20a表达水平低于存活组，差异均有统计学意义（P＜0.05）。多因素Logistic回归分析结果显示，低分化、TNM分期Ⅲ期、淋巴结转移、miR-196a＞0.94为影响CSCC患者预后不良的独立危险因素（P＜0.05），而miR-20a＞0.80为独立保护因素（P＜0.05）。Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示，癌组织中miR-20a高表达组患者的生存曲线高于miR-20a低表达组患者（Log-rank χ 2=4.152，P=0.042），癌组织中miR-196a高表达组患者的生存曲线低于miR-196a低表达组患者（Log-rank χ 2=4.879，P=0.027）。结论CSCC患者癌组织中miR-20a低表达、miR-196a高表达与分化程度、TNM分期、淋巴结转移和不良预后有关，故miR-20a、miR-196a可能成为预测CSCC患者预后不良的新型生物标志物。